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Prédire des structures biomoléculaires avec Boltz2 v1.0.0

Utilisez cette ressource pour prédire la structure de complexes biomoléculaires et estimer leur affinité de liaison avec Boltz2

Nouveau

  • 529 téléchargements
  • 231 mentions J'aime
  • 117 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install biomolecular-structure-prediction-nim

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent choisit le mode (API NVIDIA hébergée ou Docker local), construit la requête à partir de vos séquences et de vos ligands, puis enregistre le résultat au format mmCIF avec les scores de confiance. Il contrôle aussi la chimie des ligands.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Prédire des structures biomoléculaires avec Boltz2 »

Caractéristiques

Fonctionne dans
Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
CC-BY-4.0

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Tout voir

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : procédure et règles de sortie
  • references/parameters.md : réglages de prédiction et d'affinité
  • references/validation.md : contrôles mmCIF, confiance et chimie

Pour qui

  • Vous voulez modéliser une protéine avec un petit ligand
  • Vous voulez un score d'affinité pour classer des candidats

Pas pour qui

    Étiquettes

    • boltz2
    • protéines
    • affinité
    • structure
    • biologie

    À propos

    Vous dites

    « Prédis la structure de cette protéine en complexe avec ce ligand SMILES et donne l'affinité. »

    Carte de la skill « Prédire des structures biomoléculaires avec Boltz2 »

    Skill publiée par nvidia sous licence CC-BY-4.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de prédire la structure de complexes biomoléculaires et estimer leur affinité de liaison avec Boltz2
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • BENCHMARK.md7 Ko
    • config/skillspector-baseline.yml0,9 Ko
    • evals/config.yml0,1 Ko
    • evals/evals.json6,7 Ko
    • evals/trigger_evals.json2,3 Ko
    • LICENSE11,3 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/api.md5,8 Ko
    • references/examples.md2,1 Ko
    • references/parameters.md1,7 Ko
    • references/science.md1,7 Ko
    • references/validation.md1,3 Ko
    • skill-card.md4,2 Ko
    • SKILL.md5,5 Ko
    • skill.oms.sig6,3 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    nvidia
    Source
    github.com/nvidia/skills/tree/ca116d60beafe1b4459f0ab790b7b450912c56b0/skills/bionemo-boltz2-nim
    Licence
    CC-BY-4.0

    Notice

    « boltz2-nim » (nvidia, CC-BY-4.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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