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Analyse de la chromatine et de l'épigénome v1.0.0

Utilisez cette ressource pour analyser la chromatine et les éléments régulateurs d'une région ou d'un tissu

Nouveau

  • 475 téléchargements
  • 176 mentions J'aime
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Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install chromatin-epigenomics-analysis

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent commence par classer la question (marque d'histone, eQTL, impact d'un variant), puis interroge ENCODE, Roadmap et ChIP-Atlas et annote les cCRE proches d'un gène.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Analyse de la chromatine et de l'épigénome »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
Apache-2.0

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    • Claude Code
    • Codex
    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : classement de la question et choix des outils
  • SKILL.md : marques d'histones, accessibilité et cCRE

Pour qui

  • Vous cherchez les éléments régulateurs proches d'un gène
  • Vous comparez l'accessibilité de la chromatine entre deux tissus

Pas pour qui

    Étiquettes

    • chromatine
    • ENCODE
    • ATAC-seq
    • histones

    À propos

    Vous dites

    « Quels cCRE sont proches de TP53 ? »

    Carte de la skill « Analyse de la chromatine et de l'épigénome »

    Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de analyser la chromatine et les éléments régulateurs d'une région ou d'un tissu
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE11,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • SKILL.md13,8 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    mims-harvard
    Source
    github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-epigenomics-chromatin
    Licence
    Apache-2.0

    Notice

    « tooluniverse-epigenomics-chromatin » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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