GratuitSkills
Commits, branches et synchronisation avec la CLI but
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Prédiction de structure protéique avec MSA v1.0.0
Utilisez cette ressource pour prédire une structure protéique à partir d'un alignement MSA avec OpenFold3
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install msa-protein-structure-pipelineSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent recherche les homologues avec MSA-Search, extrait l'alignement A3M et compte les séquences, puis le transmet à OpenFold3 pour la prédiction. La séquence et l'alignement sont envoyés à des API NVIDIA hébergées à chaque appel ; utilisez des NIM locaux pour des séquences confidentielles. Vous obtenez une structure prédite et son alignement.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- CC-BY-4.0
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- Codex
- Cursor
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : procédure en deux étapes
- evals/evals.json : cas d'évaluation
- skill-card.md : fiche de la skill
Pour qui
- Vous voulez une prédiction de structure qui s'appuie sur le contexte évolutif
- Votre séquence a peu d'homologues dans la PDB
Pas pour qui
Étiquettes
- protéine
- MSA
- OpenFold3
- structure
À propos
Vous dites
« Prédis la structure de cette séquence protéique avec un alignement MSA. »
Skill publiée par nvidia sous licence CC-BY-4.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de prédire une structure protéique à partir d'un alignement MSA avec OpenFold3
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- BENCHMARK.md7,8 Ko
- evals/evals.json7,9 Ko
- LICENSE11,3 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- skill-card.md4,1 Ko
- SKILL.md6,6 Ko
- skill.oms.sig4,5 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- nvidia
- Source
- github.com/nvidia/skills/tree/ca116d60beafe1b4459f0ab790b7b450912c56b0/skills/bionemo-msa-structure-prediction-pipeline
- Licence
- CC-BY-4.0
Notice
« msa-structure-prediction-pipeline » (nvidia, CC-BY-4.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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