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Prédiction de structure monomère avec OpenFold2 NIM v1.0.0

Utilisez cette ressource pour prédire la structure 3D d'une chaîne protéique avec OpenFold2 NIM

Nouveau

  • 592 téléchargements
  • 162 mentions J'aime
  • 163 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install openfold2-monomer-structure-prediction

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent choisit le mode hébergé ou local, prépare la séquence et les alignements optionnels, puis envoie la requête. Vous obtenez le fichier de structure et les contrôles de validité à effectuer avant de l'interpréter.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Prédiction de structure monomère avec OpenFold2 NIM »

Caractéristiques

Fonctionne dans
Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
CC-BY-4.0

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Tout voir

Ce que vous obtenez

  • references/api.md : points d'accès, schémas et options Docker
  • references/parameters.md : effets des alignements et des modèles
  • references/validation.md : contrôles des résultats

Pour qui

  • Vous avez une séquence protéique dont la structure n'est pas connue
  • Vous voulez une structure monomère rapide à partir d'une séquence

Pas pour qui

    Étiquettes

    • openfold2
    • structure protéique
    • repliement
    • nim

    À propos

    Vous dites

    « Prédis la structure de cette séquence protéique avec OpenFold2 en mode hébergé. »

    Carte de la skill « Prédiction de structure monomère avec OpenFold2 NIM »

    Skill publiée par nvidia sous licence CC-BY-4.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de prédire la structure 3D d'une chaîne protéique avec OpenFold2 NIM
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • BENCHMARK.md7 Ko
    • config/skillspector-baseline.yml0,9 Ko
    • evals/config.yml0,1 Ko
    • evals/evals.json7,4 Ko
    • evals/trigger_evals.json2 Ko
    • LICENSE11,3 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/api.md4,6 Ko
    • references/examples.md1,9 Ko
    • references/parameters.md1,9 Ko
    • references/science.md2,9 Ko
    • references/validation.md1,5 Ko
    • skill-card.md4,4 Ko
    • SKILL.md7,2 Ko
    • skill.oms.sig6,3 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    nvidia
    Source
    github.com/nvidia/skills/tree/ca116d60beafe1b4459f0ab790b7b450912c56b0/skills/bionemo-openfold2-nim
    Licence
    CC-BY-4.0

    Notice

    « openfold2-nim » (nvidia, CC-BY-4.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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