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Prédiction de structures biomoléculaires avec OpenFold3 NIM v1.0.0

Utilisez cette ressource pour prédire des structures biomoléculaires et des complexes avec OpenFold3 NIM

Nouveau

  • 400 téléchargements
  • 120 mentions J'aime
  • 230 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install openfold3-biomolecular-complex-prediction

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent choisit le point d'accès, gère l'authentification et construit les requêtes pour protéines, acides nucléiques, ligands et assemblages. Vous obtenez les fichiers de sortie et les scores de confiance, avec les limites connues de l'outil.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Prédiction de structures biomoléculaires avec OpenFold3 NIM »

Caractéristiques

Fonctionne dans
Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
CC-BY-4.0

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Tout voir

Ce que vous obtenez

  • references/api.md : points d'accès et réponses
  • references/parameters.md : champs des molécules, MSA et modèles
  • references/validation.md : contrôles des fichiers et de cohérence scientifique

Pour qui

  • Vous modélisez un complexe protéine-ligand
  • Vous voulez prédire un assemblage protéine-ARN à plusieurs chaînes

Pas pour qui

    Étiquettes

    • openfold3
    • complexe
    • biomoléculaire
    • nim

    À propos

    Vous dites

    « Prédis la structure du complexe entre cette protéine et ce ligand avec OpenFold3. »

    Carte de la skill « Prédiction de structures biomoléculaires avec OpenFold3 NIM »

    Skill publiée par nvidia sous licence CC-BY-4.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de prédire des structures biomoléculaires et des complexes avec OpenFold3 NIM
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • BENCHMARK.md7,6 Ko
    • config/skillspector-baseline.yml0,3 Ko
    • evals/evals.json6,9 Ko
    • evals/trigger_evals.json2,2 Ko
    • LICENSE11,3 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/api.md5,9 Ko
    • references/examples.md2,3 Ko
    • references/parameters.md2,7 Ko
    • references/science.md2,6 Ko
    • references/validation.md2,5 Ko
    • skill-card.md4,1 Ko
    • SKILL.md7,6 Ko
    • skill.oms.sig6,1 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    nvidia
    Source
    github.com/nvidia/skills/tree/ca116d60beafe1b4459f0ab790b7b450912c56b0/skills/bionemo-openfold3-nim
    Licence
    CC-BY-4.0

    Notice

    « openfold3-nim » (nvidia, CC-BY-4.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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