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Analyse de la régulation génomique v1.0.0

Utilisez cette ressource pour annoter les éléments régulateurs et prédire l'effet d'une séquence non codante

Nouveau

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Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install regulatory-genomics-analysis

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent croise les motifs JASPAR, les sites UniBind, les cCRE d'ENCODE et les scores RegulomeDB, et peut prédire l'activité régulatrice d'une séquence avec des modèles d'apprentissage profond.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Analyse de la régulation génomique »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
Apache-2.0

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    • Claude Code
    • Codex
    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : phases de découverte des motifs et des sites de liaison
  • SKILL.md : prédiction par modèles de séquence et annotation

Pour qui

  • Vous interprétez un variant GWAS situé hors gène codant
  • Vous cherchez les facteurs de transcription qui se fixent à une région

Pas pour qui

    Étiquettes

    • régulation
    • facteurs de transcription
    • cCRE
    • non codant

    À propos

    Vous dites

    « Quels facteurs de transcription se fixent près de ce promoteur ? »

    Carte de la skill « Analyse de la régulation génomique »

    Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de annoter les éléments régulateurs et prédire l'effet d'une séquence non codante
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE11,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • SKILL.md26,6 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    mims-harvard
    Source
    github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-regulatory-genomics
    Licence
    Apache-2.0

    Notice

    « tooluniverse-regulatory-genomics » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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