GratuitSkills
Création d'un wiki de connaissances
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Exporter une analyse reproductible v1.0.0
Utilisez cette ressource pour rendre une analyse bioinformatique reproductible et portable
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install reproducible-analysis-bundleSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent fige l'environnement de l'analyse dans un fichier Conda, génère une définition Singularity ainsi qu'un Dockerfile avec docker-compose, puis convertit les commandes en pipeline Nextflow ou Snakemake. Vous obtenez un paquet d'analyse qu'un autre laboratoire peut relancer.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- MIT
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : export de l'environnement Conda et définition Singularity
- SKILL.md : Dockerfile, docker-compose et pipelines Nextflow ou Snakemake
Pour qui
- Vous devez partager une analyse avec un autre laboratoire ou un relecteur
- Vous voulez relancer une analyse six mois plus tard sans rien casser
Pas pour qui
Étiquettes
- reproductibilité
- conda
- nextflow
- conteneur
À propos
Vous dites
« Exporte cette analyse de variants en paquet reproductible avec Conda et Nextflow. »
Skill publiée par aaaaqwq sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de rendre une analyse bioinformatique reproductible et portable
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE1,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- SKILL.md1,7 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- aaaaqwq
- Source
- github.com/aaaaqwq/agi-super-team/tree/4c7b20bc52ad8d4a89fa3f5185abc455ef9248de/skills/repro-enforcer
- Licence
- MIT
Notice
« repro-enforcer » (aaaaqwq, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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