GratuitSkills
Création d'un wiki de connaissances
- 418418 téléchargements
- 129129 mentions J'aime
- 161161 sauvegardes
Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Contrôle qualité et alignement de séquences v1.0.0
Utilisez cette ressource pour traiter des données de séquençage, du contrôle qualité au fichier BAM
Nouveau
- 568 téléchargements
- 119 mentions J'aime
- 147 sauvegardes
Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install sequencing-qc-alignment-pipelineSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent lance FastQC, nettoie les adaptateurs avec fastp ou Trimmomatic, aligne les lectures avec BWA-MEM2, Bowtie2 ou Minimap2, puis trie, indexe et calcule la couverture. Vous obtenez un rapport MultiQC et un pipeline reproductible.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- MIT
Ressources similaires
Tout voir- Gratuit
GratuitSkills
Contrôle de santé du wiki
- 552552 téléchargements
- 202202 mentions J'aime
- 127127 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Interroger son wiki
- 374374 téléchargements
- 131131 mentions J'aime
- 214214 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Ajouter une source au wiki
- 315315 téléchargements
- 230230 mentions J'aime
- 246246 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Agent auditeur de wiki
- 556556 téléchargements
- 205205 mentions J'aime
- 192192 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Assistant de recherche UX
- 598598 téléchargements
- 142142 mentions J'aime
- 236236 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Agent d'ingestion de wiki
- 437437 téléchargements
- 162162 mentions J'aime
- 191191 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
GratuitSkills
Agent bibliothécaire de wiki
- 304304 téléchargements
- 120120 mentions J'aime
- 217217 sauvegardes
Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Ce que vous obtenez
- SKILL.md : contrôle qualité, nettoyage des adaptateurs et alignement
- SKILL.md : traitement BAM, rapport MultiQC et export du flux en script shell ou Nextflow
Pour qui
- Vous recevez des lectures de séquençage à contrôler avant analyse
- Vous voulez transformer une série d'étapes en pipeline reproductible
Pas pour qui
Étiquettes
- séquençage
- alignement
- bam
- contrôle qualité
À propos
Vous dites
« Contrôle la qualité de ces lectures, nettoie les adaptateurs, puis aligne-les sur le génome de référence. »
Skill publiée par aaaaqwq sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de traiter des données de séquençage, du contrôle qualité au fichier BAM
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE1,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- SKILL.md1,7 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- aaaaqwq
- Source
- github.com/aaaaqwq/agi-super-team/tree/4c7b20bc52ad8d4a89fa3f5185abc455ef9248de/skills/seq-wrangler
- Licence
- MIT
Notice
« seq-wrangler » (aaaaqwq, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
Avis des utilisateurs
–
Aucune note pour l'instant
Chargement des avis…