GratuitSkills
Création d'un wiki de connaissances
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
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Pipeline d'analyse scRNA-seq v1.0.0
Utilisez cette ressource pour automatiser une analyse de transcriptomique single-cell
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install single-cell-rnaseq-pipelineSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent enchaîne le contrôle qualité et le filtrage des doublets, la normalisation, la réduction de dimension (PCA, UMAP), le clustering Leiden ou Louvain, l'expression différentielle et les figures. Vous obtenez les étapes du pipeline et des visualisations.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- MIT
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Agent d'ingestion de wiki
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Agent bibliothécaire de wiki
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : capacités du pipeline, du contrôle qualité à la visualisation
- SKILL.md : dépendances et exemples de requêtes
Pour qui
- Vous devez caractériser un jeu de données single-cell
- Vous cherchez les gènes marqueurs de chaque cluster
Pas pour qui
Étiquettes
- scRNA-seq
- bioinformatique
- clustering
À propos
Vous dites
« Lance le clustering Leiden de ce jeu de données scRNA-seq et liste les gènes marqueurs. »
Skill publiée par aaaaqwq sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de automatiser une analyse de transcriptomique single-cell
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE1,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- SKILL.md1,7 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- aaaaqwq
- Source
- github.com/aaaaqwq/agi-super-team/tree/4c7b20bc52ad8d4a89fa3f5185abc455ef9248de/skills/scrna-orchestrator
- Licence
- MIT
Notice
« scrna-orchestrator » (aaaaqwq, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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