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Générer et optimiser des molécules avec MolMIM v1.0.0

Utilisez cette ressource pour générer et optimiser de petites molécules autour d'un SMILES de départ avec MolMIM

Nouveau

  • 424 téléchargements
  • 146 mentions J'aime
  • 209 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install small-molecule-latent-optimization-nim

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent choisit le mode (API hébergée ou Docker local), prépare le SMILES de départ, lance l'échantillonnage autour de lui ou l'optimisation CMA-ES, puis valide les molécules produites. Les propriétés visées sont le QED ou le plogP.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Générer et optimiser des molécules avec MolMIM »

Caractéristiques

Fonctionne dans
Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
CC-BY-4.0

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Tout voir

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : modes, flux d'optimisation et procédure
  • references/parameters.md : réglages de génération et d'échantillonnage
  • references/validation.md : contrôles SMILES et propriétés

Pour qui

  • Vous voulez des variantes d'une molécule de départ
  • Vous optimisez le QED de candidats

Pas pour qui

    Étiquettes

    • molmim
    • molécules
    • espace latent
    • optimisation
    • qed

    À propos

    Vous dites

    « Optimise cette molécule de départ avec MolMIM pour augmenter son QED. »

    Carte de la skill « Générer et optimiser des molécules avec MolMIM »

    Skill publiée par nvidia sous licence CC-BY-4.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de générer et optimiser de petites molécules autour d'un SMILES de départ avec MolMIM
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • BENCHMARK.md7 Ko
    • config/skillspector-baseline.yml0,9 Ko
    • evals/config.yml0,1 Ko
    • evals/evals.json6,2 Ko
    • evals/trigger_evals.json1,8 Ko
    • LICENSE11,3 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/api.md4,6 Ko
    • references/examples.md2,2 Ko
    • references/parameters.md2 Ko
    • references/science.md2,3 Ko
    • references/validation.md1,8 Ko
    • skill-card.md4,1 Ko
    • SKILL.md7,6 Ko
    • skill.oms.sig6,3 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    nvidia
    Source
    github.com/nvidia/skills/tree/ca116d60beafe1b4459f0ab790b7b450912c56b0/skills/bionemo-molmim-nim
    Licence
    CC-BY-4.0

    Notice

    « molmim-nim » (nvidia, CC-BY-4.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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