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Décomposition d'ascendance par ACP (SGDP) v1.0.0

Utilisez cette ressource pour situer une cohorte génétique dans le contexte mondial

Nouveau

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Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install ancestry-pca-sgdp

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

À partir d'un fichier VCF et d'une carte des populations, l'agent retrouve les variants communs avec le panel de référence SGDP inclus, lance une ACP avec PLINK et sépare votre cohorte des populations de référence. Vous obtenez une figure multi-panneaux prête pour une publication, avec un guide d'interprétation.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Décomposition d'ascendance par ACP (SGDP) »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
MIT

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    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : pipeline (VCF, variants communs, ACP PLINK)
  • SKILL.md : guide d'interprétation et citation

Pour qui

  • Vous voulez situer une cohorte par rapport à 164 populations
  • Vous préparez une figure d'ascendance pour un article

Pas pour qui

    Étiquettes

    • génétique
    • ACP
    • populations

    À propos

    Vous dites

    « Projette ma cohorte VCF dans l'ACP de référence SGDP et génère la figure. »

    Carte de la skill « Décomposition d'ascendance par ACP (SGDP) »

    Skill publiée par Manuel Corpas sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de situer une cohorte génétique dans le contexte mondial
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE1,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • SKILL.md4,9 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    Manuel Corpas
    Source
    github.com/aaaaqwq/agi-super-team/tree/4c7b20bc52ad8d4a89fa3f5185abc455ef9248de/skills/claw-ancestry-pca
    Licence
    MIT

    Notice

    « claw-ancestry-pca » (Manuel Corpas, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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