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Stockage et requêtes de variants génomiques v1.0.0

Utilisez cette ressource pour stocker et interroger des appels de variants génomiques

Nouveau

  • 409 téléchargements
  • 100 mentions J'aime
  • 134 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install genomic-variant-storage

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent crée ou complète le jeu de données, ingère les échantillons, lance les requêtes par région et exporte les sous-ensembles. Vous obtenez le code d'ingestion et de requête, ainsi que des contrôles qualité.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Stockage et requêtes de variants génomiques »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
MIT

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Tout voir

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : installation, création de cohorte, requêtes et export
  • references/ : vérifications et références officielles

Pour qui

  • Vous ajoutez régulièrement des échantillons à une cohorte
  • Vous voulez extraire une même région pour de nombreux échantillons

Pas pour qui

    Étiquettes

    • variants
    • VCF
    • génomique

    À propos

    Vous dites

    « Ajoute ce VCF d'un échantillon à ma cohorte et exporte la région chr1 de tous les échantillons. »

    Carte de la skill « Stockage et requêtes de variants génomiques »

    Skill publiée par k-dense-ai sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de stocker et interroger des appels de variants génomiques
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE1,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/verification.md6,1 Ko
    • SKILL.md13,8 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    k-dense-ai
    Source
    github.com/k-dense-ai/scientific-agent-skills/tree/5f2bc0341354fd5590aef76a533ada1e1e5b4e62/skills/tiledbvcf
    Licence
    MIT

    Notice

    « tiledbvcf » (k-dense-ai, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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