GratuitSkills
Commits, branches et synchronisation avec la CLI but
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Pipelines d'analyse génomique reproductibles v1.0.0
Utilisez cette ressource pour construire un pipeline d'analyse génomique reproductible
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install genomics-pipeline-workflowsSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent organise les étapes du traitement de données de séquençage, choisit un gestionnaire de workflows et signale les erreurs de pipeline fréquentes. Vous obtenez une chaîne d'analyse traçable et des contrôles qualité à chaque étape.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- Apache-2.0
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Compatible avec- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Ce que vous obtenez
- SKILL.md : méthode et rôle de l'agent en bioinformatique
- references/patterns.md : modèles de workflows, d'appel de variants et de RNA-seq
- references/sharp_edges.md : erreurs de référence, de version et de qualité des données
Pour qui
- Vous devez rejouer une analyse de séquençage et obtenir les mêmes résultats
- Votre pipeline RNA-seq donne des résultats différents selon la machine
Pas pour qui
Étiquettes
- génomique
- pipeline
- ngs
- bioinformatique
- reproductibilité
À propos
Vous dites
« Structure un pipeline d'appel de variants avec versions figées des outils et contrôle qualité après chaque étape. »
Skill publiée par omer-metin sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de construire un pipeline d'analyse génomique reproductible
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE10,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- references/patterns.md14,3 Ko
- references/sharp_edges.md8,1 Ko
- references/validations.md3,7 Ko
- SKILL.md1,1 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- omer-metin
- Source
- github.com/omer-metin/skills-for-antigravity/tree/e8dcf4e8737921a10088bd5c9eb65e81f74c051f/skills/genomics-pipelines
- Licence
- Apache-2.0
Notice
« genomics-pipelines » (omer-metin, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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