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Utilisez cette ressource pour analyser une étude de métagénomique amplicon ou shotgun
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Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install metagenomics-taxonomic-analysisSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent commence par le contexte de l'étude, classe les taxons selon GTDB, contrôle la qualité des génomes assemblés (complétude, contamination) et relie le microbiome aux phénotypes cliniques.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Vous dites
« Quels taxons GTDB dominent dans cette étude fécale, et sont-ils liés à la maladie ? »

Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Référencée sans modification
« tooluniverse-metagenomics-analysis » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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