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Prédiction locale de structures de protéines v1.0.0

Utilisez cette ressource pour prédire et comparer des structures de protéines en local

Nouveau

  • 523 téléchargements
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Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install protein-structure-prediction-2

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent exécute AlphaFold (ColabFold), Boltz-1 ou Chai sur votre machine, récupère des structures expérimentales dans la PDB et calcule le RMSD et le TM-score. Vous obtenez un rapport avec rendus 3D, graphiques de confiance pLDDT et PAE, et tableaux de comparaison.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Prédiction locale de structures de protéines »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
MIT

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    • Claude Code
    • Codex
    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : rôle de l'agent, dépendances et exemples de requêtes
  • SKILL.md : cartes de confiance pLDDT et PAE, comparaison de structures

Pour qui

  • Vous comparez une structure prédite à une structure de référence
  • Vous voulez évaluer la confiance d'un modèle de repliement

Pas pour qui

    Étiquettes

    • protéines
    • AlphaFold
    • biologie

    À propos

    Vous dites

    « Prédis la structure de cette séquence et compare-la à la structure expérimentale de la PDB. »

    Carte de la skill « Prédiction locale de structures de protéines »

    Skill publiée par aaaaqwq sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de prédire et comparer des structures de protéines en local
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE1,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • SKILL.md1,6 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    aaaaqwq
    Source
    github.com/aaaaqwq/agi-super-team/tree/4c7b20bc52ad8d4a89fa3f5185abc455ef9248de/skills/struct-predictor
    Licence
    MIT

    Notice

    « struct-predictor » (aaaaqwq, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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