GratuitSkills
Création d'un wiki de connaissances
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Rendu et analyse de structures de protéines v1.0.0
Utilisez cette ressource pour visualiser, aligner et rendre des structures de protéines avec PyMOL
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install protein-structure-renderingSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent exécute PyMOL sur la machine via uv, avec un rendu logiciel qui ne demande ni carte graphique ni écran. Il produit des images, superpose des structures, mesure des distances et des contacts, met en évidence des sites de liaison et colore par B-factor ou pLDDT. Il ne fait ni amarrage moléculaire, ni dynamique moléculaire, ni analyse de séquences seules.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- Apache-2.0
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : prérequis, notice de licence PyMOL et exemple de script de rendu
- references/RECIPES.md : recettes d'analyse et de rendu
Pour qui
- Vous voulez une image du site de liaison d'une protéine pour un article
- Vous superposez deux structures pour les comparer
Pas pour qui
Étiquettes
- PyMOL
- protéine
- structure
- rendu
À propos
Vous dites
« Fais une image de la protéine avec son site actif en surbrillance, colorée par pLDDT. »
Skill publiée par google-deepmind sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de visualiser, aligner et rendre des structures de protéines avec PyMOL
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE11,3 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- references/citation.bib0,1 Ko
- references/PYMOL_REFERENCE.md5,5 Ko
- references/RECIPES.md11,4 Ko
- SKILL.md6,6 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- google-deepmind
- Source
- github.com/google-deepmind/science-skills/tree/4de6786171f1479026da5d3a00f110703c8ba35e/skills/pymol
- Licence
- Apache-2.0
Notice
« pymol » (google-deepmind, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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