GratuitSkills
Création d'un wiki de connaissances
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Compatible avec
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- et 3 autres
Annotation fonctionnelle des variants protéiques v1.0.0
Utilisez cette ressource pour annoter fonctionnellement un variant protéique avec son contexte structural et populationnel
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install protein-variant-functional-annotationSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent normalise la notation du variant, lance une annotation complète (FAVOR) ou ProtVar, puis ajoute les fréquences gnomAD, le score CADD et la validité du gène. Il ne produit pas de classement ACMG complet.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- Apache-2.0
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : normalisation, annotation complète et contexte structural
- SKILL.md : fréquences, scores et niveaux de preuve
Pour qui
- Vous annotez un lot de variants faux-sens pour un pipeline
- Vous voulez le contexte protéique d'un variant avant un classement ACMG
Pas pour qui
Étiquettes
- annotation
- faux-sens
- ProtVar
- CADD
À propos
Vous dites
« Annote ces variants faux-sens avec ProtVar, gnomAD et CADD. »
Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de annoter fonctionnellement un variant protéique avec son contexte structural et populationnel
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE11,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,6 Ko
- SKILL.md14,1 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- mims-harvard
- Source
- github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-variant-functional-annotation
- Licence
- Apache-2.0
Notice
« tooluniverse-variant-functional-annotation » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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