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Requêtes reproductibles dans des bases publiques v1.0.0

Utilisez cette ressource pour récupérer un fait issu d'une base nommée, de façon reproductible

Nouveau

  • 469 téléchargements
  • 109 mentions J'aime
  • 134 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install reproducible-database-queries

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent choisit la base faisant autorité, résout les identifiants, fait des appels bornés et journalise la requête. Vous obtenez des résultats avec leur provenance et les éléments nécessaires pour les répéter.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Requêtes reproductibles dans des bases publiques »

Caractéristiques

Fonctionne dans
Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
MIT

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    • Codex
    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : flux de travail, choix de la base, formats d'identifiants et limites d'accès
  • references/ : une fiche par base (par exemple ChEMBL, AlphaFold, cBioPortal ou Census)

Pour qui

  • Vous devez vérifier un chiffre dans une base scientifique ou réglementaire
  • Vous voulez une liste complète d'entrées avec une pagination contrôlée

Pas pour qui

    Étiquettes

    • bases de données
    • API
    • reproductibilité

    À propos

    Vous dites

    « Récupère toutes les cibles ChEMBL liées à ce composé et indique la version de la base. »

    Carte de la skill « Requêtes reproductibles dans des bases publiques »

    Skill publiée par k-dense-ai sous licence MIT. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de récupérer un fait issu d'une base nommée, de façon reproductible
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE1,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • references/addgene.md1,8 Ko
    • references/alphafold.md3 Ko
    • references/alphavantage.md8,2 Ko
    • references/bea.md14,7 Ko
    • references/bindingdb.md3 Ko
    • references/biogrid.md3,9 Ko
    • references/bls.md9,3 Ko
    • references/brenda.md2,9 Ko
    • references/cbioportal.md7,6 Ko
    • references/census.md9,2 Ko
    • references/chebi.md3,6 Ko
    • references/chembl.md2,7 Ko
    • references/clinicaltrials.md3,5 Ko
    • references/clinpgx.md1,5 Ko
    • references/clinvar.md4,3 Ko
    • references/cod.md3,1 Ko
    • references/cosmic.md1,4 Ko
    • references/dailymed.md1,8 Ko
    • references/database_selection_guide.md10,2 Ko
    • references/datacommons.md7,2 Ko
    • references/dbsnp.md3,6 Ko
    • references/disgenet.md1,4 Ko
    • references/drugbank.md1,4 Ko
    • references/ecb.md5,3 Ko
    • references/emdb.md1,1 Ko
    • references/ena.md10,3 Ko
    • references/encode.md1,8 Ko
    • references/ensembl.md14,5 Ko
    • references/epa.md1,9 Ko
    • references/eurostat.md7,5 Ko
    • references/fda.md2,2 Ko
    • references/federal-reserve.md6,9 Ko
    • references/fred.md10,2 Ko
    • references/gene-ontology.md4,5 Ko
    • references/geo.md3,9 Ko
    • references/gnomad.md3,6 Ko
    • references/gtex.md4,2 Ko
    • references/gwas-catalog.md1,7 Ko
    • references/hca.md1,4 Ko
    • references/hpo.md1,2 Ko
    • references/human-protein-atlas.md1,2 Ko
    • references/interpro.md3,5 Ko
    • references/jaspar.md1,5 Ko
    • references/kegg.md2,6 Ko
    • references/lincs-l1000.md2,2 Ko
    • references/materials-project.md4,9 Ko
    • references/metabolomics-workbench.md3,9 Ko
    • references/monarch.md1,5 Ko
    • references/mousemine.md1,6 Ko
    • references/myvariant.md1,3 Ko
    • references/nasa-exoplanet-archive.md4,4 Ko
    • references/nasa.md3,1 Ko
    • references/ncbi-gene.md1,7 Ko
    • references/ncbi-protein.md3,3 Ko
    • references/ncbi-taxonomy.md3,8 Ko
    • references/nist.md3,7 Ko
    • references/noaa.md6,9 Ko
    • references/omim.md3,5 Ko
    • references/opentargets.md7,4 Ko
    • references/openweathermap.md8,4 Ko
    • references/pdb.md3,3 Ko
    • references/pride.md1,4 Ko
    • references/pubchem.md3,6 Ko
    • references/quickgo.md1,5 Ko
    • references/reactome.md3 Ko
    • references/regulomedb.md2,1 Ko
    • references/retrieval-contract.md7,4 Ko
    • references/rummageo.md1,4 Ko
    • references/sdss.md4,5 Ko
    • references/sec-edgar.md8,6 Ko
    • references/simbad.md12,7 Ko
    • references/sra.md4,6 Ko
    • references/string.md8 Ko
    • references/tcga-gdc.md2 Ko
    • references/treasury.md7,4 Ko
    • references/ucsc-genome.md3,5 Ko
    • references/uniprot.md7,4 Ko
    • references/usgs.md10,2 Ko
    • references/uspto.md4,7 Ko
    • references/who.md9 Ko
    • references/worldbank.md7,2 Ko
    • references/zinc.md5,9 Ko
    • SKILL.md27,3 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    k-dense-ai
    Source
    github.com/k-dense-ai/scientific-agent-skills/tree/5f2bc0341354fd5590aef76a533ada1e1e5b4e62/skills/database-lookup
    Licence
    MIT

    Notice

    « database-lookup » (k-dense-ai, MIT) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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