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Mécanisme d'un variant par les traits SAE d'ESMC-6B v1.0.0

Utilisez cette ressource pour expliquer mécaniquement pourquoi un variant missense est délétère

Nouveau

  • 379 téléchargements
  • 145 mentions J'aime
  • 185 sauvegardes

Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install sae-feature-variant-mechanism

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent calcule les traits du modèle de langue de protéines avant et après la mutation, repère les traits perdus ou gagnés (site catalytique, liaison, modification, motif) et rédige une explication. Il complète les scores de pathogénicité sans les remplacer.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Mécanisme d'un variant par les traits SAE d'ESMC-6B »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
Apache-2.0

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    • Claude Code
    • Codex
    • Cursor
    • et 3 autres

Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : résolution de l'entrée et construction des séquences
  • SKILL.md : traits perdus ou gagnés et résumé du mécanisme

Pour qui

  • AlphaMissense classe un variant comme nocif, et vous cherchez pourquoi
  • Vous voulez expliquer une perte de fonction par un mécanisme

Pas pour qui

    Étiquettes

    • SAE
    • ESMC
    • mécanisme
    • missense

    À propos

    Vous dites

    « Pourquoi ce variant de TP53 est-il perte de fonction, selon les traits SAE ? »

    Carte de la skill « Mécanisme d'un variant par les traits SAE d'ESMC-6B »

    Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de expliquer mécaniquement pourquoi un variant missense est délétère
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE11,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,6 Ko
    • SKILL.md12,7 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    mims-harvard
    Source
    github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-protein-sae-variant-interpretation
    Licence
    Apache-2.0

    Notice

    « tooluniverse-protein-sae-variant-interpretation » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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