GratuitSkills
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Compatible avec
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Analyse de génomique du cancer avec TCGA et GDC v1.0.0
Utilisez cette ressource pour analyser une cohorte TCGA par type de cancer
Nouveau
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Gratuit
Installer avec la CLI
Dans un terminal, depuis le dossier voulu :
npx --yes palatekit@latest install tcga-cancer-genomics-analysisSans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.
Première fois : connectez la CLI avec
npx --yes palatekit@latest loginL'agent définit d'abord la cohorte dans le GDC, puis calcule les fréquences de mutations, les données cliniques et les courbes de survie. Il indique la taille de l'échantillon et la valeur p, et rappelle que ces cohortes ne sont pas stratifiées par traitement.
Choisie surtout par
Mise à jour le 2 novembre 2026
Aperçus
Caractéristiques
- Fonctionne dans
- Guides d'installation
- Génère avec
- Le modèle de votre agent
- Licence
- Apache-2.0
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Ce que vous obtenez
- SKILL.md : définition de la cohorte et phases d'analyse
- SKILL.md : mutations, survie et variations de nombre de copies via Progenetix
Pour qui
- Vous comparez la fréquence d'une mutation entre deux types de cancer
- Vous cherchez un lien entre une mutation et la survie dans une cohorte
Pas pour qui
Étiquettes
- TCGA
- GDC
- mutations
- survie
À propos
Vous dites
« Quelle est la fréquence des mutations de TP53 dans l'adénocarcinome pulmonaire ? »
Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.
Voir plusVoir moins
Comment l'utiliser
- Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
- Demandez à votre agent de analyser une cohorte TCGA par type de cancer
- Relisez et ajustez le résultat
Aperçu du contenu
Fichiers
- LICENSE11,1 Ko
- NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
- SKILL.md15,4 Ko
Origine et licence
Référencée sans modification
- Auteur
- mims-harvard
- Source
- github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-cancer-genomics-tcga
- Licence
- Apache-2.0
Notice
« tooluniverse-cancer-genomics-tcga » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.
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