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Du variant au mécanisme biologique v1.0.0

Utilisez cette ressource pour retracer la chaîne causale d'un variant jusqu'à sa conséquence

Nouveau

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Gratuit

Installer avec la CLI

Dans un terminal, depuis le dossier voulu :

npx --yes palatekit@latest install variant-to-mechanism-analysis

Sans option, la skill va dans ~/.agents/skills/ ; ajoutez --agent claude-code (ou codex, cursor…) pour viser un agent.

Première fois : connectez la CLI avec

npx --yes palatekit@latest login

L'agent interroge plus de sept bases sur trois niveaux de preuve (régulateur, moléculaire, maladie) et construit un modèle mécanistique gradué. Il sert à remonter d'un signal GWAS jusqu'au gène causal.

Choisie surtout par

Mise à jour le 2 novembre 2026

Carte de la skill « Du variant au mécanisme biologique »

Caractéristiques

Guides d'installation
Génère avec
Le modèle de votre agent
Licence
Apache-2.0

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    • Claude Code
    • Codex
    • Cursor
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Ce que vous obtenez

  • SKILL.md : caractérisation du variant et interrogation des bases
  • SKILL.md : niveaux de preuve et chaîne causale rapportée

Pour qui

  • Un signal GWAS doit être relié à un gène causal
  • Vous voulez tracer un eQTL jusqu'à la voie concernée

Pas pour qui

    Étiquettes

    • variant
    • mécanisme
    • GWAS
    • eQTL

    À propos

    Vous dites

    « Quel mécanisme relie le variant rs429358 à mon phénotype ? »

    Carte de la skill « Du variant au mécanisme biologique »

    Skill publiée par mims-harvard sous licence Apache-2.0. Fichiers livrés dans leur version d'origine, en anglais.

    Voir plus

    Comment l'utiliser

    1. Installez la skill dans le dossier de skills de votre agent
    2. Demandez à votre agent de retracer la chaîne causale d'un variant jusqu'à sa conséquence
    3. Relisez et ajustez le résultat

    Aperçu du contenu

    Fichiers

    • LICENSE11,1 Ko
    • NOTICE-PALATEKIT.md0,5 Ko
    • SKILL.md18,3 Ko

    Origine et licence

    Référencée sans modification

    Auteur
    mims-harvard
    Source
    github.com/mims-harvard/tooluniverse/tree/169d065deeb3e289b3ff36d665529a123bdad791/skills/tooluniverse-variant-to-mechanism
    Licence
    Apache-2.0

    Notice

    « tooluniverse-variant-to-mechanism » (mims-harvard, Apache-2.0) livré dans sa version d'origine : fiche en français et en anglais par PalateKit.

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